2023 一份老的新冠病毒变体报告

科技 2023-04-15 14:02:18 浏览
2023

XBB*在环球范畴内继续增长

迄今为止仿佛感化人数较少的国度,尤其是中国,仿佛落后于感化人数较多的国度。其余领有最新数据且远低于 XBB*平均水平的国度是日本和韩国。

最近在社交媒体上惹起关注的是XBB.1.16。XBB.1.16仿佛在印度特意广泛,在两周前采集的样本中,它仿佛占>的50%。

XBB.1.16与XBB.1.5的不同之处在于有两个额外的刺突突变:E180V和K478R。亚系XBB.1.16.1(约占XBB.1.16*的20%)顶端有刺突突变T547I。

氨基酸478在朝生型中为 T,在一切奥密克戎中突变为 K(经过 C->A 突变)。在XBB.1.16中,核苷酸A如今进一步突变为G,发生氨基酸R。因此,这不是一个两步突变,由于它总是必需2个核苷酸交流。R可以经过单个交流C->G从T抵达。

鉴于478在受体联合域中并在奥密克戎中发作突变,突变提供额外的免疫逃逸并非不正当。

一份老的新冠病毒变体报告

位点180位于N末端结构域,该区域曾经看到了许多稍微有益的突变。因此,假定E180V也可以提供一些额外的免疫逃逸并非没有情理。

思考到印度的规模、人口和相关于人口相当少的序列数量,很难估量XBB.1.16与XBB.1.5(或其余含486P但不含E180V和K478R的XBB)相比在印度的成长优势。确实仿佛有细微的成长优势,但它或者从每周30%到80%-这是清楚的,但不像过去看到的成长优势,如XBB.1.5*, BQ.1.1*或第一个奥密克戎。

XBB.1.16在印度以外也有发现:在新加坡,它占两周前采集的样本的5%左右,在美国和欧洲,它依然很稀有(略低于两周前采集的样本的1%),但正在增长。由于到目前为止印度以外的序列数量很少(约250个),因此很难牢靠地估量XBB.1.16与其余国度的XBB.1.5*相比的成长优势。印度的增长优势或者比其余国度更大,由于人群免疫力取决于感化和变异株裸露的数量和时间。

独立于XBB.1.16,K478R在其余XBB*中也观察到了486P。在这些状况下,环球增长优势仿佛不大,每周只要10-20%。但是,没有太多的数据,所以时间必需通知咱们K478R自身有多大好处。

谱系EU.1.1(XBB.1.5.26.1.1的别名)具备额外的刺突突变I410V和P521S,并且仿佛曾经超越了欧洲的亲本XBB.1.5*(别名EU与欧盟的国度代码齐全偶合)。与R346T在BA.5和BQ.1中的成长优势相似,其成长优势约为25-60%。

其余或者有益的尖峰突变

在XBB*谱系中,有许多Spike突变的频率仿佛在回升。它们依然很少见,不可牢靠地估量增长优势,但它们值得关注:

S:D80YS:D215HS:M177I型号:F456L编号:P621SS:N978S编号:K1045R

非XBB谱系

虽然XBB*谱系在环球格式中越来越占主导位置,但重要的是要留意非XBB*的多样性,由于这种谱系有或者与以后盛行的XBB*谱系有很大的抗原距离。

德尔塔-奥密克戎重组体

Delta-Omicron 重组 XBC*最近占澳大利亚序列的5%左右。有一个新的亚谱系XBC.1.6,有两个幽默的尖峰突变:R346S和M452R。该谱系在澳大利亚迅速增长到1-2%,但尚未在其余任何中央测序。丹麦的XAY*仍处于2%左右,在德国或者仍在增长(如XAY.1.1),为~1%。

BA.2.75亚谱系和重组体

CH.1.1*在欧洲的比例依然相当稳固,为10-20%,虽然估量XBB*最终将超越CH.1.1*,除非CH.1.1*取得新的有益突变。BN.1*在一些国度依然很广泛,特意是在韩国在澳大利亚,BR.2.1已从20%的峰值降落到5%以下。澳大利亚的XBF*已从1月份的峰值30%降至10%左右。在欧洲,它在大概1%的范畴内被观察到。

BA.5子世系

BA.5*(非BQ*)已低于2%,但日本(~25%)和中国(~90%)除外。欧洲和美洲的BQ.1*已降至10%以下(2022年12月的峰值为50%-80%)

BA.2子世系

BA.2.3.20谢环球各地依然零星地观察到,在韩国和日本大抵恒定为~1%(估量在菲律宾最经常出现,但最新数据是6周前的)

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