科研人员发现藏族人顺应高原的新基因

科技 2023-04-18 21:41:16 浏览
科研人员发现藏族人顺应高原的新基因

图为钻研成绩。中科院昆明生物钻研所供图

中新网昆明4月18日电(记者胡远航)记者18日从中国迷信院昆明生物钻研所得知,该所宿兵团队与西藏大学、西藏阜康医院等单位协作,发布“藏族人群千人基因组”,并发现新的高原顺应基因。相干钻研成绩于近日在《Genome Biology》宣布。

科研人员发现藏族人顺应高原的新基因

藏族人群对高海拔环境的遗传顺应是现代人顺应性退化最经典的案例之一。遗传学和考古学钻研标明藏族人群后人早在旧石器时代就迁居到了青藏高原,世代的人造抉择使得藏族人群积攒了顺应性的遗传变异,并取得了生理上的顺应特色,包含较低的血红蛋白水平、更强的低氧通气反响、更好的心肺性能和更好的生殖合过度等。

进入基因组时代以来,国际外学者应用全基因组信号扫描找到了一系列在藏族人群基因组中遭到正抉择的变异位点,共报道了682个基因。但是,因为样本量小、变异位点密度低、检测方法繁多等局限,只要EPAS1和EGNL1两个基因能在多项独立钻研中完成重复,而其余基因的抉择信号仍不确定。此外,目前的性能钻研发现这两个基因只能解释少数几个顺应性状,而其余藏族人群高原顺应性特色,比如更好的心肺性能,仍不可被目前的正抉择基因所解释。

为了片面评价藏族人群高原顺应的遗传位点,中国迷信院昆明生物钻研所宿兵团队与西藏大学、西藏阜康医院等单位协作,发生了1001个藏族人群的WGS二代数据,样本笼罩了中国青藏高原的主要人口散布区。经过对“千人藏族基因组”数据的系统剖析,发现了3500万个变异,其中超越三分之一是新发现的变异。

应用大规模WGS数据,基于藏族人群的变异位点频谱和连锁不平衡谱,钻研人员构建了首个藏族人群基因组参考面板。此外,经过经常使用多信号综合剖析方法,从新确定了藏族人群基因组中遭抵达尔文正抉择的遗传位点和基因,包含4320个高可信的受抉择位点,触及192个基因。

性能注释和富集剖析标明,这192个基因触及多个基因器官和生理系统,允许藏族人群高原顺应是多基因效应的假说。同时,钻研团队发现了4个具备强抉择信号的新基因:TMEM132C、ATP13A3、SANBR和KHDRBS2,与藏族更好的心肺性能相干。

该钻研基于大规模的藏族全基因组测序数据和发现的顺应性基因,将成为未来高原地域人群遗传和医学钻研的贵重资源。(完)

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